MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus brevis KB290 plasmid pKB290-2 DNA

Total Repeats: 680

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020821	AAC	2	6	29	34	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_020821	AGG	2	6	42	47	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020821	TAG	2	6	119	124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279619
4	NC_020821	ACT	2	6	156	161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279619
5	NC_020821	A	6	6	244	249	100 %	0 %	0 %	0 %	472279619
6	NC_020821	TC	3	6	250	255	0 %	50 %	0 %	50 %	472279619
7	NC_020821	A	6	6	365	370	100 %	0 %	0 %	0 %	472279619
8	NC_020821	TCA	2	6	443	448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279619
9	NC_020821	CGC	2	6	455	460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472279619
10	NC_020821	CTA	2	6	461	466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279619
11	NC_020821	ATT	2	6	503	508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279619
12	NC_020821	TAA	2	6	862	867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279619
13	NC_020821	TCAAAT	2	12	929	940	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	472279620
14	NC_020821	CAA	2	6	1003	1008	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279620
15	NC_020821	GCAA	2	8	1027	1034	50 %	0 %	25 %	25 %	472279620
16	NC_020821	AGAATT	2	12	1126	1137	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	472279620
17	NC_020821	CG	3	6	1190	1195	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_020821	ACA	2	6	1201	1206	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_020821	TAT	2	6	1271	1276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020821	TACA	2	8	1305	1312	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_020821	CAAT	3	12	1367	1378	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_020821	ACTTA	2	10	1385	1394	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_020821	A	6	6	1398	1403	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020821	TAC	2	6	1412	1417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_020821	A	6	6	1420	1425	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020821	AAC	2	6	1443	1448	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279621
27	NC_020821	TC	4	8	1462	1469	0 %	50 %	0 %	50 %	472279621
28	NC_020821	TGCT	2	8	1494	1501	0 %	50 %	25 %	25 %	472279621
29	NC_020821	TGT	2	6	1629	1634	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472279621
30	NC_020821	TAA	2	6	1640	1645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279621
31	NC_020821	TGTCT	2	10	1732	1741	0 %	60 %	20 %	20 %	472279621
32	NC_020821	TTG	2	6	1755	1760	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472279621
33	NC_020821	ATA	2	6	1763	1768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279621
34	NC_020821	AAC	2	6	1784	1789	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279621
35	NC_020821	AT	3	6	1803	1808	50 %	50 %	0 %	0 %	472279621
36	NC_020821	TTA	2	6	1809	1814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279621
37	NC_020821	GTC	2	6	1841	1846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472279621
38	NC_020821	TAT	2	6	1856	1861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279621
39	NC_020821	TTG	2	6	1912	1917	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472279621
40	NC_020821	ACC	2	6	1926	1931	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472279621
41	NC_020821	TA	3	6	1984	1989	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020821	T	7	7	2069	2075	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020821	TAAA	2	8	2111	2118	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020821	ATG	2	6	2147	2152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020821	TGA	2	6	2294	2299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279622
46	NC_020821	ATTA	2	8	2320	2327	50 %	50 %	0 %	0 %	472279622
47	NC_020821	TGC	2	6	2335	2340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472279622
48	NC_020821	TCA	2	6	2348	2353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279622
49	NC_020821	GAA	2	6	2386	2391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279622
50	NC_020821	ATGG	2	8	2445	2452	25 %	25 %	50 %	0 %	472279622
51	NC_020821	GTT	2	6	2732	2737	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472279622
52	NC_020821	GTT	2	6	2742	2747	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472279622
53	NC_020821	AGCC	2	8	2840	2847	25 %	0 %	25 %	50 %	472279622
54	NC_020821	TGC	2	6	2953	2958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472279622
55	NC_020821	GTCA	2	8	3085	3092	25 %	25 %	25 %	25 %	472279622
56	NC_020821	CTA	2	6	3206	3211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_020821	ATTA	2	8	3254	3261	50 %	50 %	0 %	0 %	472279623
58	NC_020821	AGCC	2	8	3334	3341	25 %	0 %	25 %	50 %	472279623
59	NC_020821	TGC	2	6	3447	3452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472279623
60	NC_020821	ACG	2	6	3465	3470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472279623
61	NC_020821	TTGG	2	8	3686	3693	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020821	CTA	2	6	3700	3705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_020821	ATTA	2	8	3748	3755	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020821	CTA	2	6	3769	3774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279624
65	NC_020821	TCC	2	6	3813	3818	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	472279624
66	NC_020821	AATC	2	8	3882	3889	50 %	25 %	0 %	25 %	472279624
67	NC_020821	ATG	2	6	3918	3923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279624
68	NC_020821	TTA	2	6	3999	4004	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279624
69	NC_020821	ATCG	2	8	4011	4018	25 %	25 %	25 %	25 %	472279624
70	NC_020821	GAC	2	6	4058	4063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472279624
71	NC_020821	ACTA	2	8	4082	4089	50 %	25 %	0 %	25 %	472279624
72	NC_020821	GTA	2	6	4228	4233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279624
73	NC_020821	ACG	3	9	4311	4319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472279624
74	NC_020821	AC	3	6	4435	4440	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_020821	AGA	2	6	4484	4489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_020821	CTT	2	6	4532	4537	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_020821	ATG	2	6	4553	4558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020821	A	6	6	4618	4623	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020821	ATTG	2	8	4746	4753	25 %	50 %	25 %	0 %	472279625
80	NC_020821	ATT	2	6	4831	4836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279625
81	NC_020821	TGT	2	6	4851	4856	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472279625
82	NC_020821	TGCAA	2	10	4860	4869	40 %	20 %	20 %	20 %	472279625
83	NC_020821	ACA	2	6	4874	4879	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279625
84	NC_020821	A	6	6	4920	4925	100 %	0 %	0 %	0 %	472279625
85	NC_020821	TGG	2	6	4956	4961	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472279625
86	NC_020821	A	7	7	5028	5034	100 %	0 %	0 %	0 %	472279625
87	NC_020821	GTT	2	6	5095	5100	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472279625
88	NC_020821	TAT	2	6	5108	5113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279625
89	NC_020821	TGA	2	6	5165	5170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279625
90	NC_020821	TAATC	2	10	5208	5217	40 %	40 %	0 %	20 %	472279625
91	NC_020821	TAT	2	6	5251	5256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279625
92	NC_020821	AAG	2	6	5371	5376	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279625
93	NC_020821	TA	3	6	5402	5407	50 %	50 %	0 %	0 %	472279625
94	NC_020821	TTA	2	6	5645	5650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279625
95	NC_020821	A	6	6	5667	5672	100 %	0 %	0 %	0 %	472279625
96	NC_020821	TAA	2	6	5711	5716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279625
97	NC_020821	A	6	6	5750	5755	100 %	0 %	0 %	0 %	472279625
98	NC_020821	ACT	2	6	5800	5805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279625
99	NC_020821	T	6	6	5869	5874	0 %	100 %	0 %	0 %	472279625
100	NC_020821	TAT	2	6	5967	5972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279625
101	NC_020821	GA	4	8	6013	6020	50 %	0 %	50 %	0 %	472279625
102	NC_020821	CTT	2	6	6037	6042	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472279625
103	NC_020821	CT	3	6	6058	6063	0 %	50 %	0 %	50 %	472279625
104	NC_020821	ACAAT	2	10	6077	6086	60 %	20 %	0 %	20 %	472279625
105	NC_020821	GTA	2	6	6149	6154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279625
106	NC_020821	TATTC	2	10	6160	6169	20 %	60 %	0 %	20 %	472279625
107	NC_020821	GACA	2	8	6172	6179	50 %	0 %	25 %	25 %	472279625
108	NC_020821	TGT	2	6	6276	6281	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472279625
109	NC_020821	ATC	2	6	6350	6355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279625
110	NC_020821	TTA	2	6	6437	6442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279625
111	NC_020821	AAC	2	6	6449	6454	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472279625
112	NC_020821	GATT	2	8	6500	6507	25 %	50 %	25 %	0 %	472279625
113	NC_020821	ATGGT	2	10	6552	6561	20 %	40 %	40 %	0 %	472279625
114	NC_020821	AGA	2	6	6582	6587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279625
115	NC_020821	TTAT	2	8	6598	6605	25 %	75 %	0 %	0 %	472279625
116	NC_020821	GATCAG	2	12	6613	6624	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	472279625
117	NC_020821	ATC	2	6	6647	6652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279625
118	NC_020821	AAT	2	6	6664	6669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279625
119	NC_020821	TAG	2	6	6687	6692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_020821	AGT	2	6	6705	6710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_020821	ATA	2	6	6778	6783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_020821	TA	3	6	6908	6913	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_020821	A	6	6	6930	6935	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_020821	T	6	6	6985	6990	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_020821	A	6	6	7139	7144	100 %	0 %	0 %	0 %	472279626
126	NC_020821	ACT	2	6	7171	7176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279626
127	NC_020821	GC	3	6	7203	7208	0 %	0 %	50 %	50 %	472279626
128	NC_020821	CG	3	6	7265	7270	0 %	0 %	50 %	50 %	472279626
129	NC_020821	GTT	2	6	7293	7298	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472279626
130	NC_020821	CA	3	6	7422	7427	50 %	0 %	0 %	50 %	472279626
131	NC_020821	GTT	2	6	7461	7466	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472279626
132	NC_020821	TGA	2	6	7494	7499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279626
133	NC_020821	CAGAT	2	10	7501	7510	40 %	20 %	20 %	20 %	472279626
134	NC_020821	GAT	2	6	7548	7553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279626
135	NC_020821	ACGC	2	8	7578	7585	25 %	0 %	25 %	50 %	472279626
136	NC_020821	TAAT	2	8	7639	7646	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_020821	TTA	2	6	7670	7675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_020821	GA	3	6	7685	7690	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_020821	ATTT	2	8	7692	7699	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_020821	TGT	2	6	7725	7730	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_020821	TAC	2	6	7765	7770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_020821	TAG	2	6	7839	7844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_020821	A	6	6	7876	7881	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_020821	CGAA	2	8	7959	7966	50 %	0 %	25 %	25 %	472279627
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147	NC_020821	ATAG	2	8	8111	8118	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_020821	CGC	2	6	8130	8135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
149	NC_020821	TA	3	6	8188	8193	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_020821	GAC	2	6	8209	8214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_020821	ACCA	2	8	8239	8246	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
152	NC_020821	TCA	2	6	8265	8270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
153	NC_020821	TCG	2	6	8310	8315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_020821	TCT	2	6	8343	8348	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472279628
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172	NC_020821	AAT	2	6	9061	9066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
173	NC_020821	A	6	6	9122	9127	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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267	NC_020821	A	6	6	13986	13991	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
268	NC_020821	TTAT	2	8	14042	14049	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
269	NC_020821	TAAGC	2	10	14061	14070	40 %	20 %	20 %	20 %	472279633
270	NC_020821	TGT	2	6	14165	14170	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472279633
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274	NC_020821	CAC	2	6	14436	14441	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472279633
275	NC_020821	ATA	2	6	14480	14485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279633
276	NC_020821	CAT	2	6	14535	14540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279633
277	NC_020821	TAA	2	6	14596	14601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279633
278	NC_020821	AATT	2	8	14686	14693	50 %	50 %	0 %	0 %	472279633
279	NC_020821	AAT	2	6	14737	14742	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472279633
280	NC_020821	CAT	2	6	15021	15026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472279633
281	NC_020821	T	6	6	15042	15047	0 %	100 %	0 %	0 %	472279633
282	NC_020821	T	7	7	15060	15066	0 %	100 %	0 %	0 %	472279633
283	NC_020821	T	6	6	15069	15074	0 %	100 %	0 %	0 %	472279633
284	NC_020821	TCGA	2	8	15086	15093	25 %	25 %	25 %	25 %	472279633
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288	NC_020821	CCT	2	6	15141	15146	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	472279633
289	NC_020821	T	6	6	15160	15165	0 %	100 %	0 %	0 %	472279633
290	NC_020821	TA	3	6	15274	15279	50 %	50 %	0 %	0 %	472279633
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292	NC_020821	GCC	2	6	15299	15304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472279633
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299	NC_020821	TGA	2	6	15581	15586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472279633
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314	NC_020821	ACA	2	6	16325	16330	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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389	NC_020821	TGGTT	2	10	20082	20091	0 %	60 %	40 %	0 %	472279638
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391	NC_020821	ATT	2	6	20233	20238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279638
392	NC_020821	GTTA	2	8	20263	20270	25 %	50 %	25 %	0 %	472279638
393	NC_020821	GGT	2	6	20277	20282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472279638
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398	NC_020821	TTTG	2	8	20422	20429	0 %	75 %	25 %	0 %	472279638
399	NC_020821	TAT	2	6	20446	20451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279638
400	NC_020821	TTCT	2	8	20514	20521	0 %	75 %	0 %	25 %	472279638
401	NC_020821	ATT	2	6	20572	20577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279638
402	NC_020821	T	6	6	20607	20612	0 %	100 %	0 %	0 %	472279638
403	NC_020821	TTG	3	9	20736	20744	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472279638
404	NC_020821	TTA	2	6	20747	20752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279638
405	NC_020821	AAG	2	6	20901	20906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279638
406	NC_020821	GTG	2	6	20928	20933	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472279638
407	NC_020821	AAG	2	6	20937	20942	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472279638
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409	NC_020821	ATT	2	6	21040	21045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472279638
410	NC_020821	A	7	7	21057	21063	100 %	0 %	0 %	0 %	472279638
411	NC_020821	GGTA	2	8	21105	21112	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
412	NC_020821	TA	3	6	21158	21163	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
413	NC_020821	AT	3	6	21234	21239	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
414	NC_020821	TAA	2	6	21355	21360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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416	NC_020821	ATT	2	6	21524	21529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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418	NC_020821	TAT	2	6	21599	21604	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
419	NC_020821	T	6	6	21714	21719	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
420	NC_020821	TGA	2	6	21748	21753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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422	NC_020821	TAAT	2	8	21797	21804	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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499	NC_020821	TTTA	2	8	26138	26145	25 %	75 %	0 %	0 %	472279641
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